Las concentraciones de bacterias altamente patógenas en las aguas y en dos especies de ostras del Golfete de Cuare, evidencian el inminente deterioro de esta Area Bajo Régimen de Administración Especial (Abrea), creada en 1972 para proteger unas once mil novecientas hectáreas.
Según Andrés Osorio, oceanógrafo con especialidad en química ambiental y miembro de Fundación La Tortuga, en un estudio publicado en el año 2004 y realizado por investigadores de la Universidad Simón Bolívar y del Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas (IVIC), se encontró presencia de bacterias que pueden ocasionar infecciones urinarias, cutáneas, pulmonares, cólera, sepsis y algunas afecciones estomacales que pueden desencadenar en ulceras. El hallazgo se encontró en el tejido de las ostras contaminadas con materia fecal extraídas de esta zona, que luego son vendidas a los visitantes del refugio de Cuare y a los del Parque Nacional Morrocoy. El proceso aumenta en temporadas de lluvia.
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